Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Colgalt2Q6NVG7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Colgalt2Q6NVG7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Colgalt2Q6NVG7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Colgalt2Q6NVG7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms