Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SphkapQ6NSW3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SphkapQ6NSW3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SphkapQ6NSW3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
SphkapQ6NSW3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SphkapQ6NSW3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.7 ms