Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NipblQ6KCD5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NipblQ6KCD5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NipblQ6KCD5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms