Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otud6aQ6IE21 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud6aQ6IE21 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud6aQ6IE21 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud6aQ6IE21 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms