Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nup62Q63850 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup62Q63850 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nup62Q63850 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms