Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20917Q62457 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20917Q62457 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20917Q62457 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms