Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Spock1Q62288 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Spock1Q62288 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spock1Q62288 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms