Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkciQ62074 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkciQ62074 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkciQ62074 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkciQ62074 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms