Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fscn1Q61553 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fscn1Q61553 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fscn1Q61553 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fscn1Q61553 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
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