Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itm2aQ61500 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Itm2aQ61500 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itm2aQ61500 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms