Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift88Q61371 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ift88Q61371 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ift88Q61371 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift88Q61371 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms