Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacna1eQ61290 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacna1eQ61290 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacna1eQ61290 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms