Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CtcfQ61164 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CtcfQ61164 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtcfQ61164 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CtcfQ61164 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtcfQ61164 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtcfQ61164 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtcfQ61164 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtcfQ61164 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtcfQ61164 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtcfQ61164 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtcfQ61164 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtcfQ61164 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtcfQ61164 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CtcfQ61164 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms