Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prpf4bQ61136 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf4bQ61136 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf4bQ61136 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf4bQ61136 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms