Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf235Q61116 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Znf235Q61116 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf235Q61116 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf235Q61116 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms