Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp17laQ61068 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17laQ61068 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17laQ61068 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17laQ61068 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17laQ61068 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17laQ61068 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17laQ61068 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17laQ61068 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17laQ61068 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17laQ61068 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17laQ61068 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17laQ61068 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17laQ61068 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms