Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Csnk2a1Q60737 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Csnk2a1Q60737 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csnk2a1Q60737 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms