Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb6Q60692 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb6Q60692 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms