Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HnrnpdQ60668 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HnrnpdQ60668 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HnrnpdQ60668 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HnrnpdQ60668 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HnrnpdQ60668 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.1 ms