Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prdm1Q60636 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prdm1Q60636 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm1Q60636 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm1Q60636 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms