Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cxcl17Q5UW37 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl17Q5UW37 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cxcl17Q5UW37 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms