Protein–RNA interactions for Protein: Q5U452

Trp53rka, MCG14616, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53rkaQ5U452 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53rkaQ5U452 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53rkaQ5U452 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trp53rkaQ5U452 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53rkaQ5U452 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53rkaQ5U452 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trp53rkaQ5U452 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trp53rkaQ5U452 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trp53rkaQ5U452 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trp53rkaQ5U452 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trp53rkaQ5U452 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53rkaQ5U452 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53rkaQ5U452 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trp53rkaQ5U452 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms