Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim38Q5SZ99 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim38Q5SZ99 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim38Q5SZ99 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim38Q5SZ99 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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