Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc92bQ5SUE3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc92bQ5SUE3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc92bQ5SUE3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 340.4 ms