Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AbrQ5SSL4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AbrQ5SSL4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms