Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf12Q5SPL2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf12Q5SPL2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf12Q5SPL2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf12Q5SPL2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf12Q5SPL2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Phf12Q5SPL2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Phf12Q5SPL2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Phf12Q5SPL2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf12Q5SPL2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf12Q5SPL2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Phf12Q5SPL2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf12Q5SPL2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf12Q5SPL2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms