Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mdc1Q5PSV9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mdc1Q5PSV9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mdc1Q5PSV9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms