Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm12185Q5NCB2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm12185Q5NCB2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm12185Q5NCB2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gm12185Q5NCB2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm12185Q5NCB2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gm12185Q5NCB2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm12185Q5NCB2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm12185Q5NCB2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm12185Q5NCB2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm12185Q5NCB2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gm12185Q5NCB2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm12185Q5NCB2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm12185Q5NCB2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms