Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fbxo39Q5NBU5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fbxo39Q5NBU5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo39Q5NBU5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms