Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

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Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mdh1bQ5F204 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mdh1bQ5F204 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mdh1bQ5F204 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mdh1bQ5F204 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms