Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eri2Q5BKS4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Eri2Q5BKS4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eri2Q5BKS4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eri2Q5BKS4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms