Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Eme2Q56A04 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Eme2Q56A04 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eme2Q56A04 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Eme2Q56A04 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms