Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srrm1Q52KI8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Srrm1Q52KI8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srrm1Q52KI8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srrm1Q52KI8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms