Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Shank3Q4ACU6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Shank3Q4ACU6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Shank3Q4ACU6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shank3Q4ACU6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shank3Q4ACU6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms