Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fam228bQ497Q6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fam228bQ497Q6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fam228bQ497Q6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fam228bQ497Q6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam228bQ497Q6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms