Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacs2Q3V3Q7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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