Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.52■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
4930567H17RikQ3V0K5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
4930567H17RikQ3V0K5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
4930567H17RikQ3V0K5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930567H17RikQ3V0K5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms