Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Garnl3Q3V0G7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Garnl3Q3V0G7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Garnl3Q3V0G7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms