Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skap1Q3UUV5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Skap1Q3UUV5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Skap1Q3UUV5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Skap1Q3UUV5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms