Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm28047Q3US59 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm28047Q3US59 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm28047Q3US59 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms