Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc190Q3URK1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc190Q3URK1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc190Q3URK1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc190Q3URK1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc190Q3URK1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc190Q3URK1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc190Q3URK1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc190Q3URK1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc190Q3URK1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc190Q3URK1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms