Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mccc2Q3ULD5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mccc2Q3ULD5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mccc2Q3ULD5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Mccc2Q3ULD5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms