Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rmdn3Q3UJU9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rmdn3Q3UJU9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rmdn3Q3UJU9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms