Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc34Q3UI66 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc34Q3UI66 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc34Q3UI66 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc34Q3UI66 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms