Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tnrc6cQ3UHC0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tnrc6cQ3UHC0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tnrc6cQ3UHC0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tnrc6cQ3UHC0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms