Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil3Q3UFQ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Carmil3Q3UFQ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Carmil3Q3UFQ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Carmil3Q3UFQ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms