Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sec24aQ3U2P1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec24aQ3U2P1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms