Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tatdn3Q3U1C6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tatdn3Q3U1C6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tatdn3Q3U1C6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tatdn3Q3U1C6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tatdn3Q3U1C6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tatdn3Q3U1C6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tatdn3Q3U1C6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tatdn3Q3U1C6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tatdn3Q3U1C6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tatdn3Q3U1C6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tatdn3Q3U1C6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tatdn3Q3U1C6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tatdn3Q3U1C6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tatdn3Q3U1C6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tatdn3Q3U1C6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms