Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdpd4Q3TT99 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdpd4Q3TT99 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdpd4Q3TT99 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdpd4Q3TT99 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 601.3 ms