Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctdnep1Q3TP92 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdnep1Q3TP92 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctdnep1Q3TP92 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdnep1Q3TP92 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms